Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1bP06795 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1bP06795 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms