Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01740 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01740 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01740 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01740 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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