Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01650 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01650 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01650 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms