Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01641 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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P01641 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01641 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01641 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01641 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01641 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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P01641 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01641 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01641 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01641 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01641 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01641 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01641 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01641 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01641 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01641 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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