Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms