Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccl20O89093 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl20O89093 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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