Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShdO88834 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShdO88834 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShdO88834 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShdO88834 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShdO88834 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms