Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms