Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a1O88207 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms