Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn4O70507 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms