Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms