Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ChkbO55229 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ChkbO55229 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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