Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl35aO55142 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms