Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms