Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copb2O55029 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms