Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms