Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FxnO35943 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FxnO35943 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FxnO35943 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FxnO35943 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FxnO35943 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FxnO35943 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FxnO35943 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FxnO35943 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FxnO35943 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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