Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms