Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms