Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps1O08983 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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