Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms