Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms