Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp35M0QWN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms