Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Lrrc2-201ENSMUST00000035076 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms