Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms