Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm8356J3QPD3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms