Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC024978J3QPC3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BC024978J3QPC3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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