Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5294J3QP53 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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