Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms