Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21976J3QNN2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21976J3QNN2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21976J3QNN2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21976J3QNN2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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