Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms