Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp408H7BX78 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms