Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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