Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcf11G3X9Z4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms