Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms