Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5160F8VPN3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms