Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3371F7CQW8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms