Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28048F7BCN0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms