Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms