Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BC067074F6RXI4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BC067074F6RXI4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
BC067074F6RXI4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BC067074F6RXI4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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