Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm340F6RGI3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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