Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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