Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms