Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gcom1E9PZ54 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms