Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms