Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsf1E9PWW9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms