Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms