Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3298E9PW80 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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