Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms