Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5934D3Z4U6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms